صادرات هندوانه از ایران همیشه با چالش بین کارشناسان تجارت و کارشناسان آب و کارشناسان کشاورزی بوده است و این موضوع بدین دلیل است که ایران در در منطقه ای خشک و نیمه خشک قرارگرفته که متوسط بارندگی آن به کمتر از ۲۵۰ میلیمتر در سال میرسد و به همین دلیل در بخشهای زیادی از کشور دچار کم آبی هستیم.
در این بین در حال حاضر ۹۰ درصد از منابع آبی در بخش کشاورزی استفاده میشود محاسبات نشان میدهد و در صورت صرفه جوئی در ۱۰ درصد از آب کشاورزی حدود ۹ میلیارد مترمکعب آب ذخیره میشود و خیلی از مشکلات در زمینه تأمین منابع آبی برطرف خواهد شد لذا در خصوص مخالفت هایی برای صادرات محصولات آببر کشاورزی همچون هندوانه نیز وجود دارد.